Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snrpb2Q9CQI7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snrpb2Q9CQI7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms