Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med4Q9CQA5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med4Q9CQA5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms