Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb3bpQ9CQ82 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms