Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpa3Q9CQ71 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpa3Q9CQ71 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms