Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms