Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Efcab2Q9CQ46 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Efcab2Q9CQ46 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms