Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc18Q9CQ07 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc18Q9CQ07 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms