Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms