Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prpf8Q99PV0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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