Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim12aQ99PQ1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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