Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scd3Q99PL7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scd3Q99PL7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms