Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lpin3Q99PI4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lpin3Q99PI4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms