Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rims1Q99NE5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rims1Q99NE5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rims1Q99NE5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms