Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pcgf6Q99NA9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcgf6Q99NA9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms