Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl43Q99N89 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms