Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tdrd1Q99MV1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd1Q99MV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms