Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkd1Q99MH6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms