Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnpo2Q99LG2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tnpo2Q99LG2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms