Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf2Q99LE6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf2Q99LE6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms