Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TriobpQ99KW3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TriobpQ99KW3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms