Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf34Q99KR6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rnf34Q99KR6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms