Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clint1Q99KN9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clint1Q99KN9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms