Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab28Q99KL7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab28Q99KL7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms