Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Reep3Q99KK1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Reep3Q99KK1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms