Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmagpQ99KC7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SmagpQ99KC7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmagpQ99KC7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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