Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Def8Q99J78 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms