Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf144aQ925F3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rnf144aQ925F3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rnf144aQ925F3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rnf144aQ925F3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rnf144aQ925F3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf144aQ925F3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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