Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim7Q923T7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim7Q923T7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms