Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpe65Q91ZQ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms