Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Creb3l3Q91XE9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Creb3l3Q91XE9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms