Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csde1Q91W50 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Csde1Q91W50 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms