Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp3Q91W36 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp3Q91W36 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms