Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rhbdd2Q8VEK2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Rhbdd2Q8VEK2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhbdd2Q8VEK2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdd2Q8VEK2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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