Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fyco1Q8VDC1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fyco1Q8VDC1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms