Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ubxn4Q8VCH8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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