Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC48

Pex12, Peroxisome assembly protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex12Q8VC48 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pex12Q8VC48 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pex12Q8VC48 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms