Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApobrQ8VBT6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApobrQ8VBT6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms