Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg10Q8R1P4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms