Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf183Q8QZS5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rnf183Q8QZS5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rnf183Q8QZS5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rnf183Q8QZS5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf183Q8QZS5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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