Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fndc5Q8K4Z2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fndc5Q8K4Z2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms