Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q6

Neil1, Endonuclease 8-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil1Q8K4Q6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neil1Q8K4Q6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neil1Q8K4Q6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms