Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrtm1Q8K377 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrtm1Q8K377 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms