Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ssh3Q8K330 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ssh3Q8K330 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms