Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Txndc11Q8K2W3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms