Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Mtmr3Q8K296 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Mtmr3Q8K296 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Mtmr3Q8K296 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Mtmr3Q8K296 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mtmr3Q8K296 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Mtmr3Q8K296 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Mtmr3Q8K296 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Mtmr3Q8K296 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mtmr3Q8K296 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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