Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prkd3Q8K1Y2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms