Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sde2Q8K1J5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms