Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn34c1Q8K193 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c1Q8K193 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms