Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cnppd1Q8K158 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnppd1Q8K158 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Cnppd1Q8K158 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms