Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sh2d5Q8JZW5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh2d5Q8JZW5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms